Nama farmasi biasanya berasal dari nama botani Latin dan terdiri dari istilah yang menunjukkan bagian tanaman atau hewan yang digunakan, diikuti oleh nama genus. Kadang-kadang nama spesies juga ditambahkan dalam kasus di mana lebih dari satu anggota genus tercakup dalam materia medica.
Radix Bupleuri adalah nama farmasi untuk akar kering dari Bupleurum chinense D.C. atau Bupleurum scorzoneraefolium Wild.; kedua spesies ini dapat saling menggantikan dalam penggunaannya. Contoh lain adalah Radix Angelicae, yang merujuk pada akar salah satu dari tiga spesies: Angelica dahurica Benth. et Hook., A. anomala Lallem., dan A. taiwaniana Boiss.
Di sisi lain, Radix Angelicae Sinensis adalah nama farmasi untuk herbal yang berbeda, dengan khasiat yang sangat berbeda dari Radix Angelicae, dan dibedakan dengan disertakannya secara eksplisit nama spesies, sinensis, dalam nama farmasi tersebut.
Dalam kasus tertentu, satu entri dalam materia medica dapat terdiri dari beberapa spesies dari genus yang berbeda. Contohnya adalah Herba Jinqiancao, yang dapat terdiri dari salah satu dari lima spesies: 1, Glechoma longituba (Nakai) Kupr.; 2, Desmodium styracifolium (Osbeck) Merr.; 3, Lysimachia christinae Hance; 4, Dichondra repens Forst.; 5, Hydrocotyle sibthorpiodes Lam. bar batrachium (Hance) Hand.-Mazz. Dalam kasus seperti ini, nama farmasi biasanya merupakan transliterasi dari nama Mandarin, yaitu "jian qian cao", didahului oleh bagian tanaman atau hewan, yang dalam hal ini adalah "Herba".
Kadang-kadang kata sifat ditambahkan pada nama farmasi untuk menunjukkan bagaimana herbal tersebut diolah secara komersial. Misalnya, Radix Rehmanniae Glutinosae Conquitae terdiri dari akar (Radix) Rehmannia glutinosa yang telah dimasak (Conquitae) dan kemudian dikeringkan. Sediaan farmasi ini dibedakan dari Radix Rehmanniae Glutinosae, yaitu herbal yang sama tetapi hanya dikeringkan tanpa dimasak. Begitu pula, Rhizoma Zingiberis Recens adalah rimpang jahe segar, sedangkan Rz Zingiberis adalah sediaan keringnya. Metode pengolahan komersial secara default adalah pengeringan atau dehidrasi, kecuali dinyatakan lain melalui pengubah tambahan dalam nama farmasi.
Singkatan yang umum digunakan untuk bagian tanaman atau hewan tertentu beserta artinya tercantum di bawah ini. Entri dicantumkan dalam urutan berikut: (1) bagian tanaman atau hewan (Latin); (2) singkatan, jika ada; (3) istilah umum dalam bahasa Inggris.
Bagian Tanaman
- Bulbus; Blb; umbi lapis
- Caulis; ujung akar
- Concretio; sekresi yang mengeras
- Cortex; Cx; korteks atau kulit kayu
- Flos; Fl; bunga
- Folium; Fm; daun
- Frucificatio; badan buah (yaitu - dari jamur)
- Fructus; Fr; buah
- Galla; empedu tanaman (tumor tanaman yang disebabkan oleh serangga atau iritan lain)
- Herba; Hb; herba, seluruh bagian tanaman
- Lignum; kayu teras
- Pasta; pasta yang dibuat dari bagian tanaman
- Pericarpium; Pc; perikarp atau "kulit"
- Pollen; serbuk sari
- Radice; akar kecil
- Radix; Rx; akar
- Ramulus; Rml; ranting
- Ramus; Rm; cabang
- Rhizoma; Rz; rimpang
- Secretio; sekresi
- Semen; S; biji
- Spica; tandan bunga
- Spora; spora (yaitu - dari jamur atau cendawan)
- Tuber; umbi
Bagian Hewan
- Carapax; karapas (bagian punggung cangkang kura-kura)
- Colla; kulit
- Concha; cangkang atau kerang, seperti pada tiram
- Cornu; tanduk
- Dens; gigi
- Gelatinum; gelatin yang diekstraksi melalui pemasakan
- Nidus; sarang
- Ootheca; kantong telur (seperti pada serangga)
- Os; tulang; kadang merujuk pada tulang yang membatu (fosil)
- Plastrum; plastron (bagian perut cangkang kura-kura)
- Squama; sisik
Lain-lain
- Conquitae; dimasak
- Recens; segar & tidak dikeringkan
- seu; atau
- et; dan
- cum; dengan